赤皮病
赤皮病是由于捕捞和运输过程中对鳅体的碰伤，或水质恶化导致细菌侵入而引发的疾病。病鳅的鳍、腹部皮肤及肛门周围会出现充血和溃烂，尤其是尾鳍和胸鳍的溃烂现象更为明显，危害较为严重。
防治方法
发现此病后，可以按每立方米水体溶解20克呋喃奈斯水溶液，浸洗病鳅15至20分钟；也可以用占全池鳅鱼体重0.04%的呋喃奈斯拌饵投喂，连续喂养3天，疗效显著。
曲骨病
曲骨病的病鳅背骨弯曲，主要是由于孵化时水温异常及缺乏维生素所致。
防治方法
在孵化时保持适宜的水温，防止水温急剧变化，并投喂混合饲料。
水霉病
水霉病通常发生在水温较低或冬季鳅体受伤后，春季易感染。病鳅身上会长满白色棉絮状的水霉。
防治方法
发现此病后，可以用2%至5%的食盐水浸洗病鳅5至10分钟，或用浓度为10毫克/升的福尔马林溶液浸洗15至30分钟，即可治愈水霉病。
寄生虫病
泥鳅种苗阶段常见有车轮虫、三代虫等寄生虫。被寄生虫侵袭的鳅苗常常浮于水面，表现出急促不安或在水面打转的状态。
防治方法
在发病鱼池中，可以按每立方米水体用0.5克硫酸铜和0.2克硫酸亚铁制成的合剂全池泼洒。
气泡病
气泡病通常发生在鳅苗阶段，因水中氧气或其他气体含量过多而导致。病鳅的肠中充气，腹部鼓起，浮于水面。
防治方法
在发病严重的池塘中，可以用浓度为1克/升的食盐水全池泼洒，或加入新鲜水体。平时投饵要注意适量、多样化，并加强水质管理，以预防此病的发生。
敌害生物
泥鳅的主要敌害生物包括蛙类、水生昆虫、鸟类及凶猛肉食性鱼类。
防治方法
1. 清除池边杂草，保持养殖环境卫生，严防蛙类侵入，发现蛙类应及时捕捉，蛙卵要及时捞除；
2. 进水口要用筛绢网拦好，防止野杂鱼随进水时进入池中；
3. 发现鸟类，及时驱赶。
