一、叶子的区别
树番茄的叶子是互生的，形状为卵形或卵状心形，约长5到15厘米，宽5到10厘米。其叶子的顶端渐尖，基部偏斜，并有明显的深弯缺口，叶缘全缘或略呈波浪状。叶面呈深绿色，而背面为淡绿色，叶柄长度在3到7厘米之间。
而番茄的叶子则为羽状复叶或羽状深裂，长度在10到40厘米之间。小叶数量通常不等，约为5到9枚，形状为卵形或矩圆形，长度在5到7厘米之间，边缘具有不规则的锯齿或裂片。
二、花朵的区别
树番茄的花朵以聚伞式花序近腋生或腋外形成，花梗长度大约在1到2厘米之间。其花萼呈辐状，直径约6毫米，表面类型有短绒毛。花冠为粉红色，直径在1.5到2厘米，具有5个深裂，裂片呈披针形。
相比之下，番茄的花朵呈黄色，花冠为辐状，直径约2厘米，花萼裂片同样呈披针形状。
三、果实的区别
树番茄的果实呈卵状，果实内汁液丰富，果实长度约为5到7厘米，表面光滑，颜色多为桔黄色或略带红色。
而番茄的果实则为扁球形或近球形，肉质鲜嫩，汁液丰富，颜色也为桔黄色或鲜红色，表面光滑。
